[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: دوره 18، شماره 47 - ( شماره 1 و 2-زیست شناسی از صفحه 667 تا 696 و زمین شناسی از صفحه 697 تا 737 1386 ) ::
جلد 18 شماره 47 صفحات 171-180 برگشت به فهرست نسخه ها
مقایسه کامپیوتری اپیتوپ‌های نواحی C2-V3-C3 گلیکوپروتئین ۱۲۰gp ایزوله ایرانی H IV-1با نواحی همولوگ در زیرگونه‌های گوناگون این ویروس
چکیده:   (1498 مشاهده)
در تحقیق حاضر اپیتوپ‌های پیش‌بینی شده در نواحی C2-V3-C3در۱۲۰ gp ایزوله ایرانی ویروس 1 HIV-بااپیتوپ‌های نواحی مشابه در زیرگونه‌های A تا I این ویروس مقایسه شده‌اند. از آن‌جا که نواحی اپیتوپ یک پروتئین مناطقی فاقد ساختمان ثانویه و آب دوست هستند که در تماس با محلول آبی‌اند از این فاکتورها برای پیش‌بینی اپیتوپ‌ها استفاده شد. تعداد نواحی هلیکس(١) و شیت‌ها(٥) درایزوله ایرانی با تعداد آن‌ها در زیرگونه F و Aبرابر بود. روش هوبارد٧ محل بالقوه گلیکوزیلاسیون را در ایزوله ایرانی تعیین کرد. در تمام زیرگونه‌های دیگر تعداد محل‌های بالقوه گلیکوزیلاسیون کم‌تر از ٧ بود. در تمام ایزوله‌ها از جمله ایزوله ایرانی، یک اپیتوپ در یک ناحیه مشابه پیش‌بینی شد. در تمام نواحی بررسی شده (به جز ایزوله ایرانی و زیرگونه‌های D و H) یک اپیتوپ طویل واحد در ناحیه‌ای دیگر پیش بینی شد. در زیرگونه H هیچ اپیتوپی در این ناحیه پیش‌بینی نشد. در ایزوله ایرانی و درزیرگونه Dدو اپیتوپ کوتاه در این ناحیه پیش‌بینی شد. آنالیز کامپیوتری، شباهت‌ها و تفاوت‌های بین موقعیت اپیتوپ‌های زیرگونه ایرانی و سایر ویروس‌های HIV-1 پیش‌بینی کرد. اگر چه ساختار اولیه ۱۲۰ gpزیرگونه ایرانی به زیرگونه B نزدیک است، برخی تفاوت‌ها بین ساختار دوم وسوم این ویروس و ساب تیپ B پیش بینی می‌شوند.
واژه‌های کلیدی: HIV-1، اپیتوپ، پیش گویی کامپیوتری، ۱۲۰gp، تنوع ژنتیکی
متن کامل [PDF 200 kb]   (428 دریافت)    
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

کد امنیتی را در کادر بنویسید >


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Computational comparison of antigenic sites of C2-V3-C3 regions of gp-120 of the Iranian HIV-1 with the homologous regions of different subtypes of the virus. Materials & Energy. 2007; 18 (47) :171-180
URL: http://jsci.khu.ac.ir/article-1-1192-fa.html

مقایسه کامپیوتری اپیتوپ‌های نواحی C2-V3-C3 گلیکوپروتئین ۱۲۰gp ایزوله ایرانی H IV-1با نواحی همولوگ در زیرگونه‌های گوناگون این ویروس. مواد و انرژی. 1386; 18 (47) :171-180

URL: http://jsci.khu.ac.ir/article-1-1192-fa.html



دوره 18، شماره 47 - ( شماره 1 و 2-زیست شناسی از صفحه 667 تا 696 و زمین شناسی از صفحه 697 تا 737 1386 ) برگشت به فهرست نسخه ها
نشریه علوم دانشگاه خوارزمی Quarterly Journal of Science  Kharazmi University